Le Secrétaire Général qui est rattaché directement au Ministre a pour mission de :

• Assister le Ministre dans l'orientation générale de la conduite des affaires concernant le département;
• Assurer, sur instruction du Ministre, toutes tâches d'étude et de prévision;
• Suppléer le Ministre dans les rapports avec les administrations publiques et les autres partenaires de l'administration;
• Représenter le Ministre dans toutes les réunions se rapportant aux activités du ministère; 
• Assister le Ministre dans l'exercice de la tutelle du département sur les organismes placés sous sa tutelle; 
• Assurer, dans le cadre des missions dévolues au département, le contrôle, la coordination et l'animation des activités des directions, divisions et services du ministère, à l'exception de l'inspection générale qui est rattachée directement au Ministre, et des entités dont les textes d'organisation prévoient leur rattachement direct au Ministre.

A ce titre, il supervise le courrier administratif, planifie le travail et assure la mise en exécution des instructions du Ministre conformément à la législation en vigueur et il est responsable devant lui de la continuité de la marche des services.

• Assurer la gestion des services du département ministériel et à ce titre, il est chargé notamment de : 
  1. La gestion du personnel;
  2. La préparation et l'exécution du budget du ministère;
  3. L'élaboration des projets de textes ayant trait aux domaines d'activités du département;
  4. L'instruction des questions juridiques et contentieuses concernant les services du ministère.